Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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GABRA6Q16445 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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GABRA6Q16445 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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GABRA6Q16445 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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GABRA6Q16445 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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GABRA6Q16445 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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GABRA6Q16445 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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