Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL1Q16048 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL1Q16048 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL1Q16048 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL1Q16048 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL1Q16048 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL1Q16048 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL1Q16048 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL1Q16048 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL1Q16048 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL1Q16048 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL1Q16048 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL1Q16048 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL1Q16048 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL1Q16048 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL1Q16048 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PMCHL1Q16048 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL1Q16048 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms