Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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