Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms