Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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RAB3GAP1Q15042 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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RAB3GAP1Q15042 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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RAB3GAP1Q15042 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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RAB3GAP1Q15042 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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RAB3GAP1Q15042 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3GAP1Q15042 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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RAB3GAP1Q15042 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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