Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NR1D2Q14995 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms