Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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CHD4Q14839 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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CHD4Q14839 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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CHD4Q14839 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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CHD4Q14839 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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CHD4Q14839 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
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CHD4Q14839 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHD4Q14839 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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