Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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