Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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CUL1Q13616 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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