Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms