Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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