Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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BNIP3Q12983 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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