Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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RAB40BQ12829 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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RAB40BQ12829 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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RAB40BQ12829 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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RAB40BQ12829 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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RAB40BQ12829 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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RAB40BQ12829 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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RAB40BQ12829 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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RAB40BQ12829 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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RAB40BQ12829 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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RAB40BQ12829 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB40BQ12829 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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