Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms