Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms