Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EP300Q09472 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EP300Q09472 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EP300Q09472 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EP300Q09472 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EP300Q09472 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EP300Q09472 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EP300Q09472 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EP300Q09472 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EP300Q09472 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EP300Q09472 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EP300Q09472 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms