Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms