Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE3AQ05086 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms