Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms