Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP7AQ04656 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7AQ04656 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms