Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms