Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BEX3Q00994 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms