Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIM1P81133 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIM1P81133 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIM1P81133 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIM1P81133 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms