Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX1P78414 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX1P78414 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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