Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms