Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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