Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTBP60709 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ACTBP60709 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms