Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL3P58215 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms