Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BGRP55822 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BGRP55822 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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