Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK1EP49674 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms