Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARCN1P48444 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARCN1P48444 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms