Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms