Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMPOP42166 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMPOP42166 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms