Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBRP36941 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBRP36941 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms