Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PTGER1P34995 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PTGER1P34995 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PTGER1P34995 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PTGER1P34995 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PTGER1P34995 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PTGER1P34995 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PTGER1P34995 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PTGER1P34995 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PTGER1P34995 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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PTGER1P34995 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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