Protein–RNA interactions for Protein: P34897

SHMT2, Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHMT2P34897 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHMT2P34897 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHMT2P34897 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHMT2P34897 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHMT2P34897 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHMT2P34897 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHMT2P34897 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms