Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LMO1P25800 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms