Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms