Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT1P21579 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms