Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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CXCL3P19876 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CXCL3P19876 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CXCL3P19876 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CXCL3P19876 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CXCL3P19876 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CXCL3P19876 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CXCL3P19876 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CXCL3P19876 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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