Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GATA1P15976 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GATA1P15976 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GATA1P15976 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GATA1P15976 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GATA1P15976 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GATA1P15976 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms