Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms