Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBL4AP11441 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms