Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM10L1P0DMW3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM10L1P0DMW3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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