Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGB3P05106 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGB3P05106 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms