Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms