Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEBLO76041 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEBLO76041 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms