Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms