Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX1O43933 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX1O43933 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX1O43933 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX1O43933 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX1O43933 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX1O43933 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms