Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYNGR2O43760 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms